动物麻醉及处死过程应迅速进行，这既符合动物伦理要求，也能避免动物组织死后自溶，从而影响实验结果的准确性。
在取材时，应对动物模型的外表和脏器进行肉眼观察，并做相应的实验记录。
取材人员应对所取样本有充分了解，取材过程要迅速。对于易自溶的组织，如肠道和腺体，应优先处理。
取材时使用的剪刀和刀片应保持锋利，镊子尽量避免使用齿镊，夹取脏器时应用无齿镊夹住其周围的结缔组织。
如无特殊要求，所选组织应尽量包含脏器的全部层次或重要结构。若相同器官需要多次取材，选材部位应尽量保持一致。
剖检应在设有解剖台的解剖室内进行，小动物可在大小适宜的搪瓷盘内进行。剖检完成后，应及时对用具和场地进行严格消毒，特别是处理死于传染病的动物尸体时，要严防病原扩散。
动物尸体应及时收入冰柜，并按照医疗垃圾的处理方法进行妥善处理。
*注：动物尸检时，常被忽视的体表检查也非常重要。例如，四肢水肿可能提示动物生前患有心脏、肝脏、肾脏或关节炎症等疾病；尾巴坏死可能是外伤（如夹伤、打斗等）或注射时损伤血管导致血液供应不足造成的；天然孔如口腔、鼻孔周围有血液，可能是食道或上呼吸道损伤；肛门周围污秽则可能提示动物生前有腹泻现象，多患有肠道疾病等。